Rabauke Marcus trifft eines Tages auf das streunende Digimon Agumon. Nach anfänglichen Schwierigkeiten freunden sich die beiden auf der Flucht vor der Digitalen Abwehr-Taktik Sondereinheit an. Diese erkennt schließlich die außergewöhnlichen Kampffähigkeiten der beiden an und rekrutiert sie. Als sie in Merukimon einen übermächtigen Gegner finden, müssen sich Marcus und Agumon mit ihrem Team selbst in die DigiWelt begeben. Werden sie den Frieden zwischen den Digimon und den Menschen wiederherstellen können? (9 DVDs)