Milo Thatch, ein tollpatschiger Sprachwissenschaftler, träumt von der Entdeckung der versunkenen Stadt Atlantis. Eines Tages wird Milo tatsächlich Teil einer Expedition, die sich auf die gefährliche Entdeckerreise begibr. Milos kühnste Träume werden übertroffen, als er und sein Team Atlantis und dessen Bewohner tatsächlich entdecken. Allerdings versucht der skrupellose Expeditionsführer Rourke, die geheimnisvolle Energiequelle von Atlantis in seine Gewalt zu bringn. Wird Milo es schaffen, Atlantis vor dem endgültigen Untergang zu bewahren?