In einem von Riesen­monstern („Kaiju“) bedrohten Japan arbeitet Kafka Hibino in der aufreibenden Monster­entsorgung — weit entfernt von seinem Traum, sich der Anti-Kaiju Abwehr­truppe anzuschließen. Als er seine Jugend­freundin Mina Ashiro wieder­trifft, die bereits zur Elitetruppe gehört, fasst Kafka neuen Mut. Doch plötzlich verwandelt er sich selbst in den mächtigen „Kaiju?No.?8“. Mit Unterstützung seines jungen Kollegen Reno Ichikawa verbirgt er seine Identität, strebt die Aufnahmeprüfung an und kämpft darum, an Minas Seite stehen zu dürfen. Doch als eine rätselhafte, intelligente Kaiju-Bedrohung die Verteidigungsbasis angreift, steht Kafka vor einer folgenschweren Entscheidung...